保函保证金是指针对银行保证函所支付的保证金。
保函(Letter of Guarantee, L/G)又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。保证在申请人未能按双方协议履行起责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定期限范围内的某种支付责任或经济赔偿责任。 保函即为保证书，为了方便，一般公司及银行都印有一定格式的保证书。其作用包括凭保函交付货物、凭保函签发清洁提单、凭保函倒签预借提单等。
经办人应与业务部门加强沟通，随时掌握企业投标、中标、合同谈判、签约及合同执行每一个环节的情况，熟悉标书及合同中有关银行保函的条款，弄清银行保函的具体要求，必备的担保内容及保函开具及送达后，受理人或受益人应确认的文件。
及时注销银行保函。
保函的保证金是银行或者担保公司对申请出具保函的人收取的保证金，此保证金主要是为了约束申请人的某些责任。同时对于在银行办理保函的相关流程也给大家进行了非常详细的介绍，正规情况下，保函的保证金的数额都不会太多的。
银行保函是由银行开立的承担付款责任的一种担保凭证，银行根据保函的规定承担付款责任。银行保函大多属于“见索即付”（无条件保函），是不可撤销的文件。银行保函的当事人有委托人（要求银行开立保证书的一方）、受益人（收到保证书并凭此向 银行索偿的一方）、担保人（保函的开立人）。