把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
投标保函：
主要用于国际投标与招标业务，通常是招标人要求投标人参加投标的条件之一。银行(担保人)应投标人(申请人)的申请，开立的以招标人为受益人的保函，保证投标人在开标之前不中途撤销投标、不片面修改投标条件或中标后不拒绝签约、不拒绝交纳履行保证金或提供银行的履约保函，否则银行将支付给招标人一定的金额作为赔偿。其目的在于表明投标人的诚意与资格。
履约保函：
是银行(担保人)应交易合同中的一方当事人(申请人)的请求，开立的以另一方当事人为受益人的保函，承诺在申请人未能履行合同规定的义务时，银行将支付给受益人一定金额作为赔偿。
还款保函又称预付款保函或定金保函。是指担保人应合同一方当事人的申请，向合同另一方当事人开立的保函。保函规定，如申请人不履行他与受益人订立合同的义务，不将受益人预付或支付的款项退还或还款给受益人，担保人向受益人退还或支付款项。
除上述两种保函外，还可根据其他功能和用途的不同，分为其他种类的保函，如：投标保函、补偿贸易保函、来料加工保函、技术引进保函、维修保函、融资租赁保函、借款保函等等。