自然界的生物都生活在一定的生态系统里，离开了他们所适应的相对稳定的系统，生物是很难正常生存的，即使是适应力强的物种也将经历一段脆弱时期。而作为水族箱主角的鱼类和水草，如果没有一个适合他们的稳定系统，大多数会由于体质变弱而生病，甚至很快死亡。

那么一个完整的水族馆生态系统包括那些元素？

一.水族生态系统的要素：

这是一个很专业的问题，但在日常的水族养殖中用到的不多，我这里只挑重要的讲，分类上也以实用易懂为原则，未以专业的系统方法分类。

1.微生物：

包括、支原体、衣原体等简单生命体以及许多肉眼看不到的原虫类，其中重要的是。不同水体的种类和数量不同（一些专业水产书籍对此有描述，有兴趣可以到新华书店去翻翻看），但正常菌群（相对于致病菌而言）--也就是我们常简单归纳为硝化菌的那些--的作用是大同小异的，就是：分解有机物、并将氮硫等的有害化合物通过自身新陈代谢作用转化成稳定无害的物质，从而达到净化水质的目的。另外，正常菌群的维持还能有效防止致病菌的数量，从而防止多种疾病，尤其是类疾病的发生（因为在微生物疾病的感染要素里，致病微生物的数量占有举足轻重的作用）。

2.藻类：

包括硅藻、蓝藻等微小的单细胞藻类和水族箱常见的丝状藻、须状藻等多细胞藻类，这些让人既爱又恨的小家伙在水族生态中有很重要的作用。他们利用光能以及水中氮磷等化合物（为鱼类等水生生物的代谢产物和的分解产物，但由于现在天然水体污染日益严重，工业、生活污水逐渐成为氮磷的主要来源）合成糖类、蛋白质以及多种维生素，成为食物链的起始环节。就整个生物圈中的地位而言，它们远比一切高等植物来得重要，地球上植物产生的氧气中有90%来自于藻类。但当水体中的氮磷化合物过多时，他们的生长就会失控，进而争夺光照和氧气，成为鱼类和高等水生植物的杀手。目前一些地区水源污染十分严重，即使是自来水中也有相当的氮磷含量，虽然对人体影响不大，但却足以维持藻类生长，如果在新设水族箱中不注意控制，藻类会很快占据地位而难于去除，将影响水草、珊瑚等的生长，严重时也可导致鱼类窒息死亡。还要提一句的是，藻类是水生生态系统中顽强的住客，即使维护良好的水族箱，也不可能完全没有藻类存在，只不过少得让人注意不到而已。

3.浮游动物：

这里指水蚤、丰年虾、轮虫、草履虫等以细微浮游生物为食的低等动物，他们在自然水体中的数量很大，也是水族养殖重要的饲料来源，但水族箱中却不多见，影响也不明显，仅有轻微的除藻作用。

4.底栖动物：

这一类包括的范围很广，从线虫、沙蚕到蜗牛、海参，再到虾蟹、贝类等等，都可统归在一起。尽管食性、习性各不相同，但在水体生态中他们都能扮演清道夫的角色，将动植物尸体进行初步消化处理，转化成更易于分解的产物，有的还能清除藻类。我们常有意无意地将他们引入水族箱，成为维护系统稳定的好帮手，但有的物种如不加注意也会带来困扰。

5.高等水生植物：

包括常见的属种子植物的水草，以及蕨藻、钙藻之类长得很象水草的较高等海洋藻类（以下就简单地统称为水草了）。自然界他们也处于食物链的底端，虽然进化上比单细胞藻类先进，但生长所需的营养物质以及在自然中的作用和低等藻类差别不大，它们也会在营养物质过剩时大量生长，引起水生环境的恶化。当水草生长旺盛时，由于大量养分被他们消耗，藻类会因营养不良而生长缓慢；反之，低等藻类肆虐时，水草也会因为没有足够养料和光照而逐渐衰弱。另外，他们也是水质净化的重要力量，尽管低等藻类也有相同的作用，但控制高等水生植物的生长要比控制藻类容易得多，所以大多数人还是选择水草（也有造景高手用藻类在局部进行装饰，确有耳目一新之感，但并不是人人可以尝试的）。

6.高等水生动物：

这里当然是指鱼类了，他们是观赏水族的焦点所在，但不要忘记，他们也是整个系统的一个环节。鱼类在水生生态中处于食物链的顶端，他们从系统中获取能量，而他们的代谢产物也为水草、藻类和提供生长所需的养料。

7.其他：

这里着重提一下岩礁造景缸里的珊瑚和软体，他们有的是植物（虫黄藻）和动物（珊瑚虫）的共生体，有的则是纯粹的掠食者，但就水生生态系统中的地位作用而言，总体介于高等水生植物和动物之间，更偏向于动物。